Programi suradnje između susjednih zemalja namijenjeni su jačanju prekograničnih regija i financiraju se iz pretpristupnih fondova (CARDS, Phare, IPA). Pokrivaju Cilj 3 kohezijske politike EU- suradnju između susjednih država, transnacionalnih zona i međuregionalnih mreža EU i potiču ravnomjerniji razvoj regija unutar EU. Hrvatska je do sada imala priliku sudjelovati u 3 programa inicijative Interreg i to: Interreg IIIA Slovenija- Mađarska- Hrvatska, Interreg IIIA Adriatico i Interreg IIIB CADSES.

Kroz IPA-u se otvaraju mogućnosti suradnje u više programa, osim bilateralnih programa sa zemljama s kojima graničimo, otvaraju se mogućnosti i za MED- inicijativu mediteranskih zemalja i SEES- prostor jugoistočne Europe.